使用疫苗应遵循以下原则：传染性支气管炎病毒血清与病性不清楚时，应选用当地传染性支气管炎流行毒株制备多价灭活苗，应以本地区分离株为中毒，制备包括肾型，呼吸型及腺胃型在内的多价油佐剂灭活苗，方可建立多道防线。同时在地方流行血清型不清楚的情况下，应慎用一些新的血清型活疫苗。
未注意传染性支气管炎病毒对新城疫疫苗免疫的干扰因传染性支气管炎病毒对新城疫病毒有兔疫干扰作用，所以两者如使用单一疫苗需间隔10天以上，而使用联合疫苗或同时使用(剂量适当)则不会产生干扰。
及时淘汰患病幼龄母鸡因幼龄母鸡感染传染性支气管炎病毒后会引起输卵管水久性退化，丧失产蛋能力，不能留做蛋用或种用。生物安全体系不健全请参考鸡新城疫该条目的相关内容。
传染性喉气管炎（nfectiouslaryngotracheitis,ILT）是由传染性喉气管炎病毒引起的育成鸡和成年产蛋鸡的一种急性、高度接触性上呼吸道传染病临床上以呼吸困难、咳嗽、咳出血样出物，喉头和气管黏膜脚胀、魔烂、坏死、大面积出血和产蛋下降等为特征。ILT首次报道于年，我国于年检测出1LTV抗体阳性病例。目前该病在大多数国家中存在，是危害养鸡业的重要呼吸道传染病之一。中华人民共和国农业部关于《一、二、三类动物疫病病种名录》的公告(第号)将其列为二类疫病。
呼吸困难鸡传染性喉气管病鸡常表现呼吸道症状，如发出呼声、甩头、张口伸颈呼吸等，表现相似症状的其他疾病主要有禽流感、禽霍乱、新城疫、传染性支气管炎、支原体病、传染性鼻炎、曲霉菌病、白喉型/黏膜型鸡痘等。