至于许多言论指出的淡水鱼寄生虫问题，其实无论是淡水、海水鱼类，都有可能成为某些寄生虫的天然中间宿主(最终宿主为人类等哺乳动物)。而且淡水鱼体内寄生虫相对比较严重，很多寄生虫都是线形动物门与扁形动物门动物，如吸虫类。
一般来说海水中的寄生虫，因为生存环境与人体环境相差较大，对人体危害要小于淡水鱼，这和鱼体液的渗透压有关。
淡水硬骨鱼生活的淡水环境相对细胞来说，是一种低渗溶液，所以淡水硬骨鱼用鳃和皮肤吸收水分，肾脏排水，通过吸盐细胞和食物补充盐分，淡水硬骨鱼的体液渗透压不高。海水相对细胞是高渗溶液，所以海水鱼吸收海水，再通过泌盐细胞和其他途径排盐，海水鱼体液渗透压偏高。
寄生在鱼体内的寄生虫会适应鱼体液渗透压，淡水鱼体液渗透压更接近陆地人类体液渗透压，所以淡水鱼体内的寄生虫更容易在人体内存活。而海水鱼体内寄生虫则不能长时间在人体内存活。
在海水鱼体内的主要寄生虫是异尖线虫，三文鱼(大西洋鲑鱼)、大马哈鱼、金枪鱼、海鲈鱼、鳕鱼、带鱼……甚至不是鱼的乌贼都有可能携带。不过就算万一不小心吃了含异尖线虫的生鱼片，大家也不用太担心，其危害没那么大。因为人体环境对其不友好，严重者多表现为胃肠道不适，恶心、呕吐、腹泻、腹痛等。异尖线虫在人体内只能作为幼虫存活数周，在发育为成虫前死亡，因此危害相对较小。