当考虑饲料污染物时，许多人会想到硬件设施、饲料中的污物或肉眼可见的东西。然而，奶牛养殖业更清楚什么是生物水平的污染，即只有在显微镜的帮助下才能看到的污染。牛舍或田间的疾病爆发会相互影响，并且会对牧场的生态系统产生持久影响。由于该行业更清楚地了解从田间到牛舍的污染，为了获得更好的牛奶收益，农学家、营养学家和兽医需要更好地合作。正因如此，饲料、谷物和全混合日粮（TMR）的卫生或饲料清洁度成为了一个共同的话题。
许多饲料的污染是由病原体感染引起的。这里讨论的病原体可以是真菌或细菌。酵母和霉菌都是真菌；梭菌、沙门氏菌、李斯特菌和大肠杆菌都是感染性细菌。区分真菌和细菌很重要，并且需要认识到两者既可以是有益菌也可以是有害菌。有害致病菌可以直接对动物造成影响，也可能通过产生的有毒化合物对动物造成影响（例如霉菌毒素）。
由于瘤胃和较强的免疫系统，通常健康的奶牛能够抵抗病原体。然而，当致病菌增加或条件变得有利于其生长时，奶牛的生产性能和健康状态就会开始下降。
当发生免疫抑制时，产奶量和健康状态可能会进一步降低。在免疫抑制的情况下（饲料中存在霉菌毒素，在应激或围产期间），真菌和细菌可能会持续存在，导致流产、繁殖疾病、消化不良甚至死亡。
01田间的细菌或真菌
无论奶牛的健康和生产性能在任何程度受到影响，牧场都需要鉴别病原体，然后确定病原体的来源。不要只把怀疑对象放在青贮窖上，因为许多饲料中的病原体可以追溯到土壤和田间。
确保您的农学顾问也参与到饲料卫生这一环节中，并开始积极规划作物勘察和粪便管理，以确保在未来收获更干净的饲料。茎腐病和穗腐病是真菌性疾病，它们会引发问题并导致饲料中产生霉菌毒素。
通常这些疾病直到收获时才会考虑，但威斯康星大学麦迪逊分校的植物病理学家DamonSmith解释道，在收获前可以更好地鉴别此类疾病。根据农作物保护网（CropProtectionNetwork），有几种不同类型的腐病，包括曲霉属真菌、镰刀菌、赤霉菌和色二孢菌穗腐病。
与您的农学顾问和作物顾问合作，在收获前鉴别这些致病真菌。如果在去年的饲料中发现了特定的霉菌毒素，则将毒素追溯回相应种类的腐病。然后，根据过去的毒素感染案例管理田地。对于茎腐病和穗腐病，一些杂交品种具有较强的抗性。
以下这些有价值的信息点可以让读者了解不同类型的腐病：
曲霉菌腐病（橄榄绿，粉状）。此病常发生在炎热、干旱的生长条件，并可产生强效致癌的黄曲霉毒素。这种霉菌在土壤和作物残茬中都能存活，可以通过昆虫和风传播。
镰刀菌腐病（白紫色，棉花状）。此病可在更广泛的生长条件下爆发并产生霉菌毒素（伏马菌素）。镰刀菌可在生长季节之间的作物残茬上存活并且通过风或根系感染传染给其他作物。它在受损和受压的作物中更为普遍。在收割季节中，霉菌毒素通常集中出现在温暖、潮湿的条件下。
赤霉菌腐病（红色-粉红色）。在美国北部和加拿大更为常见。这种病可以产生脱氧雪腐镰刀菌烯醇和玉米赤霉烯酮。霉菌在玉米和谷物残茬上存活，也可在大豆根系上存活。
色二孢菌腐病（穗底密集的白色霉菌，最终变成灰棕色）。此病也较为常见，但在美国和加拿大却不产生已知的霉菌毒素化合物。色二孢菌能够在玉米残茬和土壤里过冬。当感染该病时，霉菌消化饲料中的淀粉，降低能量含量。
管理土壤和田地以获得最佳的植物健康状况，并咨询您的农学顾问，了解您的农场是否需要使用杀真菌剂。目前，营养学家和农学顾问只是开始认识到杀真菌剂对保证饲料洁净度效果的潜力，但不会广泛建议。访问农作物保护网以获取更多的管理信息（